संरचना कार्य का निर्धारित करत है। पौधा के अर्क के जीवाणुरोधी अऊर जीवाणुरोधी का मुख्य तंत्र संरचना मा एकर मजबूत हाइड्रोफोबिसिटी है। पौधा के अर्क जीवाणु कोशिका झिल्ली अऊर माइटोकॉन्ड्रिया पर फॉस्फोलिपिड संरचना का अलग कइ सकत हैं, कोशिका संरचना का नुकसान पहुँचा सकत हैं, कोशिका झिल्ली पारगम्यता का बढ़ा सकत हैं, जेकरे परिणामस्वरूप इंट्रासेल्युलर आयन अऊर सामग्री का रिसाव होत है, अऊर फिर जीवाणु कोशिका मृत्यु का कारण बनत है। उदाहरण के लिए, हनीसकल अर्क से निकाला गा क्लोरोजेनिक एसिड एस्चेरिचिया कोलाई के कोशिका झिल्ली के साथ मिल सकत है, जेसे कोशिका झिल्ली के पारगम्यता बढ़ जात है, अऊर उपचारित एस्चेरिचिया कोलाई जीवाणु द्रव मा क्षारीय फॉस्फेटेज के सामग्री बढ़ जात है, अऊर एस्चेरिचिया कोलाई कोशिका के क्षति दर लगभग 40% तक पहुँच जात है।
पौधा के अर्क बैक्टीरिया के आकृति विज्ञान का नुकसान पहुँचावै के लिए बैक्टीरियल पेप्टिडोग्लाइकन के संश्लेषण का रोक के बैक्टीरिया का भी मार सकत हैं, जइसे कि सिलेंड्रोमा रूट अर्क। यहिके अलावा, एकर जीवाणुरोधी तंत्र मा जीवाणु कोशिका भित्ति के विनाश या गिरावट, कोशिका प्लाज्मा झिल्ली के विनाश अऊर कोशिका झिल्ली प्रोटीन संरचना के विनाश भी शामिल है, लेकिन जीवाणु कोशिका द्रव्य एकत्रीकरण, कोशिका प्रोटॉन आंदोलन का कमजोर भी कइ सकत है, अऊर जीवाणु संक्रमण के प्रभाव का निभावै के लिए आंत के उपकला रक्षा कार्य का भी बढ़ा सकत है। उदाहरण के लिए, बर्बेरीन हाइड्रोक्लोराइड एस. ऑरियस द्वारा स्रावित -हीमोलिसिन कोशिकाओं का विकृत अऊर विकृत बना सकत है, जेहिसे कोशिका सतह असमान होइ जात है अऊर पोषक तत्व अऊर आनुवंशिक सामग्री लीक होइ जात है। बहुत संख्या मा प्रयोगात्मक अध्ययनन से पुष्टि भै है कि एकल सक्रिय घटकन के जीवाणुरोधी प्रभाव पूरे पौधा के अर्क के रूप मा अच्छा नाहीं है, जेसे पता चलत है कि विवो मा पौधा के अर्क मा प्रत्येक घटक के प्रभाव परस्पर बढ़ावा देत हैं।
अलग-अलग पौधा अर्क अलग-अलग तरीका से आंत के वनस्पति का नियंत्रित करत हैं। कुछ अलग-अलग तरीका से हानिकारक बैक्टीरिया का सीधे रोक सकत हैं, जबकि कुछ प्रोबायोटिक्स के विकास का बढ़ावा दे सकत हैं अऊर अप्रत्यक्ष रूप से हानिकारक बैक्टीरिया के प्रजनन का रोक सकत हैं। पौधा के अर्क के कुछ घटक, जइसे कि ओलिगोसैकराइड्स, मा स्पष्ट प्रोबायोटिक प्रभाव होत हैं, जवन विवो अऊर इन विट्रो मा बिफिडोबैक्टीरियम अऊर लैक्टिक एसिड बैक्टीरिया जइसन फायदेमंद बैक्टीरिया के विकास अऊर प्रजनन का बढ़ावा दे सकत हैं, अऊर अंततः हानिकारक बैक्टीरिया के संख्या का कम करत समय फायदेमंद बैक्टीरिया के संख्या बढ़ावत हैं। उदाहरण के लिए, युक्का शिडिगेरो अर्क बैक्टीरॉइड्स अऊर यूबैक्टीरिया जइसन हानिकारक बैक्टीरिया के संख्या का कम कइ सकत है, अऊर ब्रॉयलर के आंत मा हेलिकोबैक्टर के संख्या का बढ़ा सकत है। एलोवेरा अर्क साल्मोनेला संक्रमण से होए वाली मौत अऊर ब्रायलर के आंत मा साल्मोनेला के संख्या का कम कइ सकत है। पर्सलेन अर्क सीकम मा एस्चेरिचिया कोलाई के संख्या का कम कइ सकत है अऊर लैक्टोबैसिलस अऊर बिफिडोबैक्टीरियम के संख्या का बढ़ा सकत है।
